Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms