Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms