Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC35E1Q96K37 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35E1Q96K37 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms