Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRIQ1Q96JM4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
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