Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms