Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALML4Q96GE6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms