Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MVB12AQ96EY5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms