Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIFAQ96CG3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIFAQ96CG3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms