Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms