Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC59Q96AG4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms