Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms