Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms