Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms