Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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