Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHIPQ8WWQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms