Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms