Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms