Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KSR1Q8IVT5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KSR1Q8IVT5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms