Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms