Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms