Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms