Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms