Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC80Q76M96 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms