Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms