Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms