Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms