Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms