Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms