Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms