Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms