Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSSK4Q6SA08 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms