Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A47Q6Q0C1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms