Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms