Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN1Q6NZI2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms