Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms