Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEF1DP3Q658K8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms