Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms