Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIF1Q5UIP0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
RIF1Q5UIP0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIF1Q5UIP0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms