Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEXMIFQ5QGS0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEXMIFQ5QGS0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms