Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF628Q5EBL2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms