Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms