Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms