Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM71Q2Q1W2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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