Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPP1Q16831 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPP1Q16831 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPP1Q16831 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPP1Q16831 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UPP1Q16831 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UPP1Q16831 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UPP1Q16831 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UPP1Q16831 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UPP1Q16831 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms