Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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