Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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