Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms