Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SGCAQ16586 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SGCAQ16586 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SGCAQ16586 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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