Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms