Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK4Q16099 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK4Q16099 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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